山东小麦种子病害的出现时间一般在春夏季，常见的可能影响到山东小麦种子的病害主要有三种，分别是黑穗病、线虫病、毒麦，这三种病害是会很大程度上影响到小麦种子产量的。但这几种病害，只要严格山东小麦种子检疫制度，认真进行种子处理，是可以控制其危害的。
一、晒种。
播种前把山东小麦种子曝晒2-3天，并进行风选或筛选，提高种子的纯度和净度。
二、泥水或盐水选种。
主要是防治线虫病。每百斤清水中加入粘土30-40斤或食盐20斤，搅拌后用一个鸡蛋试一试比重。当鸡蛋放入泥水（或盐水）露出水面五分硬币大时即可将山东小麦种子浸入泥水中，不断搅匀捞出线虫痿粒和杂质，然后用清水将山东小麦种子淘洗干净，晒干备用。
三、石灰水浸种。
主要是防治黑穗病。可用生石灰1斤加水100斤，浸小麦种子90斤，水要高出种子表面2-3寸，浸山东小麦种子后不要反动，保持无氧灭 菌。浸山东小麦种子时间根据气温而定，气温在15℃时，浸1-2天。浸山东小麦种子后小麦种子要洗净，晒干。如浸小麦种子后遇到阴雨天一时不能播种，一定要摊在通风的地方晒干，防止霉烂和发芽。
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